Kleine Fliessgewässer gelten als die Kinderstube der Fische. Kleinwasserkraftwerke nutzen die Energie dieser Fliessgewässer zur Stromerzeugung. Damit beeinflussen sie den natürlichen Wasserhaushalt und die Gewässerökologie. Beim Bau von Kleinwasserkraftwerken wird die Restwassermenge reduziert, Wehre oder Staustufen blockieren die Wanderwege für die Fische und stören den Geschiebetransport. Eine sehr sorgfältige Planung ist notwendig, um diese Effekte zu minimieren.